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细胞DNA链断裂时,DNA的超螺旋结构受到破坏,在中性条件时,DNA片段可进入凝胶发生迁移,而在碱处理和碱性电解质的作用下,DNA发生解螺旋,损伤的DNA断链及片段被释放出来,由于这些DNA的分子量很小,所以在电泳过程中会离开核DNA向阳极移动,形成彗星状的拖尾图像,而未损伤的DNA部分停留在原位,染色后成圆形荧光团。
用途
评价单个细胞的DNA损伤(各种因素的生物反应、肿瘤的研究治疗预测)。
材料与仪器
步骤
1、单细胞悬液制备用胰酶将细胞消化至离心管道中并进行细胞计数,用PBS调节细胞密度至105~106个ml。
2、制胶首层使用80μl05%正常熔点琼脂糖滴到预热的载玻片上,迅速盖上干净的盖玻片,4℃放置10min使其凝固。
第二层是低熔点琼脂糖与细胞的混合液,取10μl含10000个细胞的PBS和75μl05%低熔点琼脂糖在37℃混匀,然后轻轻揭去盖玻片,将含细胞的低熔点琼脂糖滴到首层胶板上,立即盖上干净的盖玻片,4℃放置10min使其凝固。
第层胶制备同首层胶一致,盖上盖玻片。
3、裂解移去盖玻片,将载玻片浸入新配置的RIPA细胞裂解液中至少裂解25h(尽量使每张玻片裂解时间相同)。此步骤的目的是裂解液由去垢剂及高盐溶液组成,除去溶解细胞膜及核膜,除去蛋白质、RNA等,仅存留核骨架。
4、解旋和电泳细胞裂解后,取出载玻片,用PBS冲洗2次,然后将载玻片置于水平电泳槽中,倒入1XTBE电泳缓冲液,覆胶面025cm,碱解旋20min,4℃冰箱中电泳25~30min,电压25V。
5、染色将载玻片取出,滤纸吸干电泳缓冲液,用Tris-HCl(pH75)中和15min。然后每片载玻片上滴加50μl30μgmL的溴化乙锭(EB)溶液,避光操作,盖上盖玻片,避光染色20min,即可观察。
6、镜检核图像分析EB染色后的样本尽在荧光显微镜下观察并拍照电泳图谱。
注意事项
1、细胞消化不彻底,没有得到单个细胞,多个细胞发生粘连。
2、尾巴形状不完全或者发生扭曲。
3、裂解液处理是本验的关键,裂解液要澄清且完全溶解,裂解不彻底要延长裂解时间或考虑使用强裂解液。
4、溴化乙锭是剧物质,需做好防护,可考虑用其他核酸染料替代。
常见问题
问题1:细胞消化不彻底,没有得到单个细胞,多个细胞发生粘连。
答:细胞消化过程在孵箱中进行消化,可以用移液轻轻吹吸。
问题2:尾巴不完整或者发生扭曲。
答:制胶过程细致小心,不要产生气泡、胶面平整。剥胶过程小心细致。电泳保持在低电压且电压平稳,在4℃冰箱里电泳。
来源:丁香验 |
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